@bubu12

Ça dépend du type de test RT-PCR effectué...

Majoritairement, c’est des séquences des gènes Orf1a & b (qui inclut la zone RdRp) : Orf1a, RdRp, Orf1b... E (Enveloppe) et N (Nucléoprotéine) qui sont ciblées.

https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC7442048/
https://www.ophrp.org/upload/pdf/j-phrp-2020-11-3-05.pdf

Mais on peut faire des tests spécifiques qui recherche des séquences du gène Orf2, CAD la protéine S (Spike) pour discriminer de quel variant on parle.

Exemple :
https://www.biolab33.com/biolab33-realise-le-depistage-des-variants-du-sars-cov-2/

Mais ce n’est pas commun.

Tout dépend des amorces utilisés.

Il y a autant de méthode que de test.